„Warehouse 13“ folgt zwei Secret‑Service‑Agenten, die in ein abgelegenes Regierungsdepot in South Dakota versetzt werden. Dort lagern mysteriöse Artefakte, die übernatürliche Kräfte besitzen und deshalb gesichert und untersucht werden müssen. Die Agenten reisen zu ungewöhnlichen Fällen im ganzen Land, um solche Objekte aufzuspüren und neue Gefahren einzudämmen. Dabei entsteht ein Mix aus Abenteuer, Humor und Mystery, während das Team die Geheimnisse des riesigen Lagers erkundet.